בעתיד הרחוק, בגלקסיה מרוחקת אי שם, הברית הגלקטית נלחמת על קיומה כנגד גזע של יצורים הנקראים הידיאזו (Hidiaazu/hideauze ). במהלך קרב קשה ואינטנסיבי, הסגן הצעיר לדו Ledo)) והנשק-רובוט דמוי אנושי שלו צ'יימבר (chamber) נבלעים בעיוות זמן-חלל. לאחר שהוא מתעורר, לדו מגלה שהוא נמצא בכדור הארץ, מקור החיים הראשוני של בני האדם. כוכב זה מוצף לחלוטין בים, ובני האדם שם חיים בציים של ספינות ענק, מנסים להציל שרידים ממעמקי הימים למחייתם. לדו מגיע לאחד הציים האלו שנקרא גרגנטיה (Gargantia). חסר ידע על ההיסטוריה והתרבות של אנשי הכוכב, הוא נאלץ לחיות לצידה של איימי, נערה מקומית בת 15 המשמשת כשליחה בצי גרגנטיה. לדו שלא ראה מעולם את הים ועד כה חי חיים של הישרדות ולחימה מתמשכת, מופתע מחיי השלווה שכוללים בתוכם לא מעט הפתעות איך אדם שגדל אך ורק כדי לשרוד ולהרוג יסתדר בעולם החדש הזה?מה הוא צריך לעשות כדי להסתגל וליצור לעצמו חיים בעולם החדש?עבור מה הוא צריך לחיות עכשיו?